Identifizierung funktionell aktiver Genomelemente, die für die phänotypische Vielfalt und Plastizität beim Rind relevant sind
Ziel:
Trotz der Revolution in der funktionellen Genomanalyse klafft noch immer eine große Lücke im Verständnis der Zusammenhänge zwischen (Epi-)Genom und komplexen Phänotypen, und das erschwert die effiziente Nutzung annotierter Genome für die Präzisionszucht. Das BovReg-Konsortium erstellt eine umfassende Karte funktionell aktiver Genomelemente beim Rind und zeigt, wie sich ihre (epi)genetische Variation in Fleisch- und Milchrassen in Phänotypen niederschlägt. Das ist Schlüsselwissen für eine biologisch fundierte genomische Vorhersage, wie sie Wissenschaft und Nutztierbranche brauchen. BovReg vereint eine kritische Masse an Fachleuten aus der Wiederkäuerforschung und darüber hinaus: Bioinformatik, molekulare und quantitative Genetik, Tierzucht, Reproduktionsphysiologie, Ethik und Sozialwissenschaften. Unsere 20 Partner aus der EU, Kanada und Australien bilden ein globales interdisziplinäres Team, das auf früheren und laufenden nationalen und EU-geförderten Projekten sowie vielen etablierten Industriekooperationen aufbaut. In BovReg erzeugen wir funktionelle Genomdaten auf Basis der FAANG-Kernassays aus repräsentativen Rindergeweben und neu etablierten Zelllinien, die verschiedene Entwicklungsstadien und Phänotypen abdecken, und setzen dabei neue bioinformatische Pipelines ein. Wir erarbeiten detailliertes Wissen zu Merkmalen der Robustheit, Gesundheit und biologischen Effizienz beim Rind. Daten, Wissen und Protokolle werden in europäischen biologischen Archiven hinterlegt, mit dem Ziel, einen Wissensknoten aufzubauen und zu pflegen und Goldstandards zu etablieren. Die langfristige Verfügbarkeit der Daten sowie gezielte Verbreitung und Kommunikation sichern EMBL-EBI, FAANG und EAAP. Unsere biologisch fundierten Werkzeuge zur genomischen Vorhersage bringen Wissen über regulatorische genomische Variation in die genomischen Selektionsprogramme lokaler und globaler Rinderpopulationen ein. Dieses Wissen hilft, die Rinderhaltung neu auszurichten und dabei gesellschaftliche Erwartungen, Umwelt- und Tierschutzaspekte sowie Bioeffizienz voll zu berücksichtigen.
Link: https://cordis.europa.eu/project/rcn/223200/factsheet/en
