Fluidigm-R-pakettimme julkaistiin juuri CRANissa. Paketti on tehty helpottamaan Fluidigm-laitteiden genotyyppausaineistojen analysointia. Se tarjoaa joukon työkaluja aineiston käsittelyyn ja analysointiin, mikä helpottaa tutkijoiden työtä. Paketin keskeiset funktiot ovat:
fluidigm2PLINK(...): Muuntaa Fluidigm-aineiston PLINKin käyttämään muotoon ja luo Fluidigm-laitteen CSV-tulosteesta ped/map-tiedostoparin.estimateErrors(...): Arvioi genotyyppausaineiston virheet.calculatePairwiseSimilarities(...): Laskee näytteiden väliset parittaiset samankaltaisuudet.getPairwiseSimilarityLoci(...): Määrittää parittaisen samankaltaisuuden lokukset.similarityMatrix(...): Luo samankaltaisuusmatriisin.
Funktiot voi ajaa yksitellen tai kaikki kerralla kätevällä kääreellä fluidigmAnalysisWrapper(...).
